产酸克雷伯氏菌(K.oxytoca) α-乙酰乳酸脱羧酶基因(BudA)的克隆及生物信息学分析

作者：王长丽; 孙雯; 黄守锋; 葛菁萍

来源：黑龙江大学自然科学学报, 2016, 33(06): 795-801.

DOI：10.13482/j.issn1001-7011.2016.06.127

• Klebsiella oxytoca HD79
• α-乙酰乳酸脱羧酶
• 生物信息学分析
• 结构预测

以Klebsiella oxytoca(K.oxytoca)HD79为出发菌株,根据α-乙酰乳酸脱羧酶基因序列相似的特点,利用Primer5.0设计一对引物,以K.oxytoca HD79为模板,PCR扩增,获得K.oxytoca HD79基因片段Bud A,此片段经测序显示长度为780 bp,无碱基缺失。利用生物信息学软件对该序列进行了同源性分析、氨基酸组成分析、疏水性分析、磷酸化位点预测、亚细胞定位分析及二、三级结构预测。结果表明,该片段为K.oxytoca HD79的α-乙酰乳酸脱羧酶基因序列。对该酶进行的生物信息学特异性分析为其构建产2,3-丁二醇的工程菌株提供一定的理论参考。

• 出版日期2016
• 单位黑龙江大学; 生命科学学院