砀山酥梨TCP基因家族全基因组鉴定与分析

作者：冀志蕊; 董庆龙; 谷彦冰; 吴建圆; 迟福梅; 徐成楠; 张俊祥; 乔壮; 周宗山

来源：基因组学与应用生物学, 2017, 36(02): 766-773.

DOI：10.13417/j.gab.036.000766

• 砀山酥梨
• TCP基因家族
• 全基因组鉴定
• 进化分析

TCP蛋白是植物特有的转录因子家族之一,在植物生长和发育等多个过程起到重要作用。本研究利用生物信息学方法对砀山酥梨TCP基因家族成员、染色体定位、进化分析、亚组分类、保守域结构和保守元件进行了相关分析。结果显示,梨TCP基因家族含有34个成员;进化分析表明,根据进化树拓扑结构将其分为两类:ClassⅠ和ClassⅡ,其中ClassⅡ可被分为CYC/TB1和CIN两个小组。结构域分析表明,梨TCP基因家族TCP结构域高度保守;保守元件分析表明,梨TCP基因家族包含5个保守元件:元件1是TCP保守域;元件2为R结构域,元件3、4和5为功能尚未鉴定的结构域,所有梨TCP蛋白都含有元件1,ClassⅡ组中CYC/TB1小组包含特异元件2。以上结果将为今后揭示梨TCP基因的功能提供重要的理论基础。

• 出版日期2017
• 单位中国农业科学院果树研究所