埃可病毒1型河南分离株全基因组测序及序列分析

作者：卫海燕; 穆玉姣; 许玉玲; 黄学勇; 马宏; 陈豪敏; 许汴利

来源：中国病毒病杂志, 2013, (05): 377-381.

DOI：10.16505/j.2095-0136.2013.05.004

• 手足口病
• 埃可病毒1型
• 基因组测序
• 序列分析 Hand-foot-mouth disease
• Echovirus 1
• Genome sequence
• Phylogenetic analysis

目的了解河南省与手足口病相关的埃可病毒1型(echovirus 1,E1)河南分离株2140/Henan/2010的基因组特征,对其进行全基因测序,并与其他肠道病毒基因进行同源性比较和进化分析。方法采用RT-PCR扩增全基因,采用SeqMan将所测的全部序列进行拼接,使用MegAlign进行同源性比较,MEGA4进行进化分析。结果 2140/Henan/2010基因组全长7 325bp。与原型株Farouk比较,编码区氨基酸同源性为97.6%,核苷酸同源性为80.7%,其中P1核苷酸差异为21.2%,VP1核苷酸差异为16.5%,P2、P3核苷酸差异分别为19.9%、22.4%。进化分析发现,...

• 出版日期2013
• 单位河南省疾病预防控制中心