ABEEM/MM-MD模拟溶剂对N7质子化嘌呤核酸和芳香胺离子反应的影响

作者：王笑楠; 齐世飞; 任引哲

来源：计算机与应用化学, 2010, (04): 443-446.

DOI：10.16866/j.com.app.chem2010.04.007

• ABEEM/MM-MD
• 芳香胺离子
• 溶剂影响
• 径向分布函数
• 电荷 ABEEM/MM-MD
• arylnitrenium ion
• solvent effect
• radial distribution function
• charge

芳香胺离子是芳香胺致癌进程中产生的中间体,它与嘌呤核酸反应,生成芳香胺-DNA加成物,从而导致癌症的发生。在之前的理论研究中,我们发现,N7质子化的嘌呤与芳香胺离子反应时,过渡态的气相和液相中激发能差别很大,其具体原因还不清楚。因此,本文中,应用ABEEM/MM-MD分子动力学模拟方法,研究了溶剂对这类反应的影响。在具体的溶剂模拟中,我们使用显含的水分子作为溶剂,模拟得到了整个反应过程中N7质子化嘌呤与芳香胺离子的水的径向分布函数。分析这些结果可以发现,当反应进行到有过渡态出现时,水溶剂与过渡态的相互作用会变的比反应初始阶段强得多。从这个结果,可以得到过渡态的激发能在气相和液相中差别很大的原因...

• 出版日期2010
• 单位山西师范大学