杜仲MEP途径系列基因5′端非编码区的顺式作用元件预测

作者：乌云塔娜; 刘慧敏; 杜红岩

来源：经济林研究, 2013, (04): 9-15.

DOI：10.14067/j.cnki.1003-8981.2013.04.005

• 杜仲
• MEP途径
• 5′端非编码区
• 顺式作用元件 Eucommia ulmoides
• MEP pathway
• 5′ non-coding region
• cis-acting element

为深入了解杜仲MEP途径基因5′端非编码区的功能,在杜仲转录组和全基因组序列的基础上,利用生物信息学方法系统预测了MEP途径系列基因5′端非编码区顺式作用元件的结构和功能。生物信息学分析表明:EuDXS2基因5′端非编码区预测出共有22种共220个顺式作用元件,其中包含启动子顺式元件145个TATA-box和39个CAAT-box的可能位点;EuDXR基因5′端非编码区预测出21种共127个顺式作用元件,68个TATAbox和32个CAAT-box;EuCMK基因5′端非编码区预测出24种共134个顺式作用元件,包含32个CAAT-box和68个TATA-box;EuMDS基因5′端非编码区共...

• 出版日期2013
• 单位中国林业科学研究院; 中南林业科技大学