柯萨奇病毒A9型山东地方株的进化遗传学特征

作者：黄蓉蓉; 林小娟; 李漫时; 刘尧; 熊萍; 赵晨旭; 陶泽新^*; 徐爱强^*

来源：病毒学报, 2021, 37(06): 1333-1340.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.004056

• 柯萨奇病毒A9型(CVA9)
• 系统发生学
• 进化遗传学
• 无菌性脑膜炎(AM)

柯萨奇病毒A9型(Coxsackievirus A9,CVA9)是常见的人类肠道病毒血清型,其感染可引起无菌性脑膜炎、脑炎等疾病。为探索其进化遗传学特征,本研究对山东省1991-2018年CVA9分离株的VP1完整编码区进行了序列测定,并与GenBank中获得的全球序列一并进行系统发生学和进化遗传学分析。结果显示全球CVA9可分为I-XII 12个基因型,优势基因型为VII,包括山东株在内的所有中国分离株均属于该基因型。进化遗传学研究显示,CVA9 VP1区序列的每年每个碱基的平均进化速率约为6.25×10-3,共同祖先起源于1919年。CVA9 VP1区的基因多样性在2003年以前无明显变化,2003年以后出现明显波动。本研究为我们了解CVA9的流行趋势和遗传变异提供了数据,对CVA9相关疾病的防控和诊断试剂的研发具有重要的现实意义。

• 出版日期2021
• 单位山东省疾病预防控制中心; 公共卫生学院; 山东大学