新一代高通量测序与稳定性同位素示踪DNA/RNA技术研究稻田红壤甲烷氧化的微生物过程

作者：郑燕; 贾仲君

来源：微生物学报, 2013, (02): 173-184.

DOI：10.13343/j.cnki.wsxb.2013.02.004

• 新一代高通量测序
• 稳定性同位示踪DNA/RNA
• 稻田红壤
• 甲烷好氧氧化 next-generation sequencing
• stable-isotope probing
• red paddy soil
• aerobic methane oxidation

【目的】利用新一代高通量测序技术分析复杂土壤环境中整体微生物群落结构的变化规律,研究特定功能微生物生理过程的分子机制;利用稳定性同位素示踪微生物核酸DNA/RNA,研究复杂土壤中关键元素转化的微生物调控机制。【方法】针对我国第四纪红色粘土母质发育的3种稻田红壤,围绕13C-甲烷好氧氧化的微生物过程,在DNA和RNA水平高通量测序土壤微生物群落16S rRNA基因和16S rRNA,通过超高速密度梯度离心土壤微生物总核酸获得13C-标记的DNA/RNA,进一步采用克隆文库技术研究稻田红壤甲烷好氧氧化的微生物作用者。【结果】新一代高通量测序结果表明,3种稻田红壤甲烷的好氧氧化过程中,甲烷好氧氧化菌...

• 出版日期2013
• 单位中国科学院南京土壤研究所; 中国科学院大学; 土壤与农业可持续发展国家重点实验室