4株新城疫病毒F蛋白和HN蛋白的计算机模建与表面抗原分析

作者：胡思科; 席瑞珍; 任涛; 廖明

来源：华南农业大学学报, 2013, (01): 87-92.

• F蛋白
• HN蛋白
• 模建
• 表面蛋白溶剂可及表面积(ASA) fusion protein
• hemagglutinin-neuraminidase protein
• homology modeling
• solvent-accessible surface area(ASA)

选取新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)广东分离毒GM株(强毒株)和JM株(弱毒株)以及疫苗毒La-Sota株和标准强毒F48E9株,对其融合蛋白(F)和神经氨酸酶(HN)的编码基因序列进行分析,并利用Insight II软件包(Version 2000)进行F蛋白和HN蛋白C端蛋白单体的空间结构模建.结果显示,4个NDV毒株F蛋白单体分子的空间结构极为相似,大致分为3部分,即头部、茎部和柄部.其中头部结构主要由一些折叠股组成,茎部和柄部主要由螺旋结构组成.比较各毒株F蛋白表面蛋白溶剂可及表面积(ASA)后发现,该蛋白有5个线性B细胞表位和8个比较保守的抗原决定...

• 出版日期2013
• 单位华南农业大学; 河南理工大学