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摘要
提出了一种基于隐半马尔科夫模型(HSMM)和K-means的混合算法,用于对纳米孔数据中出现的多级事件进行分析。通过K-means对检测到的阻断事件进行分析,确定纳米孔信号中的电流幅值水平个数,将其作为HSMM模型的隐状态输入;然后采用HSMM识别多级事件内部的不同水平,确定各水平的幅值和持续时间。最后将算法与Opennanopore软件进行比较,对三级、四级事件进行处理。仿真结果发现:HSMM比Opennanopore软件的准确率高,能够准确对事件进行分级。
- 出版日期2017
- 单位华东理工大学
