米氏凯伦藻18S rDNA和转录间隔区序列分析

作者：郑俊斌; 张凤英; 马凌波; 陆亚男

来源：上海海洋大学学报, 2009, (06): 680-685.

• 米氏凯伦藻
• 核糖体18S rDNA
• 转录间隔区
• 系统进化
• 分子鉴定 Karenia mikimotoi
• ribosomal 18S rDNA
• internal transcribed space(ITS)
• phylogenetic evolution
• molecular identification

对赤潮多发藻米氏凯伦藻(Karenia mikimotoi)核糖体18S rDNA及其转录间隔(ITS)区序列PCR扩增并测序,获得18S rDNA和ITS基因序列长度分别为1 690 bp和654 bp。结合12种甲藻和1种硅藻作序列比较分析,分别在ITS1、ITS2序列寻找到适宜设计特异性引物探针区域,并用邻接法构建系统进化树,研究各藻种间亲缘关系。遗传距离分析结果显示米氏凯伦藻与短凯伦藻(Karena brevis)、微小卡罗藻(Karlodinium micrum)等分类学上较近的藻种18S rDNA序列相似度为97%~99%,远大于微小原甲藻(Prorocentrum minimum...

• 出版日期2009
• 单位上海海洋大学; 中国水产科学研究院东海水产研究所