大豆SBP转录因子家族的预测分析

作者:朱命喜; 刘洋; 吴琼; 刘春燕; 徐晶; 陈庆山; 胡国华
来源:大豆科学, 2011, 30(02): 177-183.

摘要

SBP转录因子基因家族是一个植物的特异转录因子家族,SBP基因都含有一段保守的核苷酸序列即DNA结合结构域,又称为SBP盒(SBP-box),SBP盒编码的蛋白质序列称SBP结构域(SBP-domain),含79个氨基酸残基,并具有高度保守性。该研究通过对拟南芥、水稻等植物已知的转录因子与大豆基因组数据比对,并设置一系列严格的筛选标准,共得到44条新的大豆SBP转录因子;又通过基因分析注释以及启动子功能预测,进一步发现这些转录因子参与生长发育、逆境胁迫响应、激素应答、抗霉菌应答、光合作用等调控过程。