microRNA-296-5p靶基因的预测及在肺发育中的应用

作者:张颖慧; 杨洋; 张存; 孙祎璠; 朱雯; 马程玲; 周晓玉
来源:中国当代儿科杂志, 2016, 18(12): 1302-1307.

摘要

目的对rno-micro RNA-296-5p(mi R-296)靶基因预测并进行相关生物信息学分析,为深入研究mi R-296与胎肺发育相关的生物学功能提供理论依据。方法应用Pub Med、Google等信息搜索工具检索mi R-296的现有研究,并通过mi RBase获取其序列特征以及进化的保守性;利用Target Scan数据库进行mi R-296的靶基因预测;并利用DAVID Bioinformatics Resources 6.8数据库对靶基因进行功能富集分析;利用KEGG数据库对靶基因进行信号转导通路分析。结果已有的文献表明mi R-296在许多生物学过程中发挥重要作用,序列在多物种间高度保守。mi R-296调控的靶基因参与分子功能、细胞组分和生物学过程等方面,靶基因集合的信号转导通路显著富集于MAPK信号通路、Wnt信号通路、TGF-β信号通路等(均P<0.05)。结论通过对mi R-296靶基因的生物信息学分析,为研究mi R-296在肺发育中的作用提供了功能与机制的线索。