我国新疆首次检出西伯利亚型蜱传脑炎病毒

作者：刘然; 张桂林; 刘晓明; 李裕昌; 郑重; 孙响; 杨银辉

来源：病毒学报, 2016, (01): 26-31.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.002864

• 蜱传脑炎病毒
• 西伯利亚型
• 深度测序
• 小RNA
• 新疆 Tick-borne encephalitis virus
• Siberia subtype
• Deep sequencing
• Small RNAs
• Xinjiang

对新疆地区蜱传病毒类群进行调查,本研究利用Illumia深度测序技术对新疆全沟硬蜱体内的病毒小RNA分子进行筛查,从提取的蜱小RNA组份中共测得32 631条病毒特异性读序,77条读序与蜱传黄病毒基因组序列匹配,核苷酸数合计约占病毒基因组的3.8%~2.4%,其中32条读序与国内尚未发现的西伯利亚型蜱传脑炎病毒一致。为对上述结果进行确证,利用RT-PCR对此型病毒核酸进行检测,从蜱总RNA中分别扩增获得病毒包膜基因与基因组3′末端片段,测序比对表明上述片段序列与西伯利亚南部检出病毒高度近似,核苷酸与氨基酸似然率分别为97.2%~95.5%与99.4%~98.3%。综上所述,本研究利用基于深度测...

• 出版日期2016
• 单位新疆军区疾病预防控制中心; 病原微生物生物安全国家重点实验室; 军事医学科学院