应用iTRAQ技术筛选DNT差异表达蛋白

作者：廖秋林; 张伟; 彭大云; 王蔚; 张海燕; 陈晓东

来源：中华神经外科疾病研究杂志, 2016, 15(06): 506-509.

• 胚胎发育不良性神经上皮肿瘤
• 蛋白质组学
• 同位素标记相对和绝对定量技术
• 生物标记物

目的应用同位素标记相对和绝对定量蛋白质组学技术(iTRAQ)筛选胚胎发育不良性神经上皮肿瘤(DNT)差异表达蛋白。方法将DNT实体组织标本(2例)与正常脑组织标本(2例),各组标本混合后提取蛋白,进行定量和酶解。iTRAQ标记后进行液相串联质谱分析。通过Mascot软件进行图谱分析。结果实验匹配到的谱图数量是82 300张,其中特有谱图数量为57 738张,共鉴定到2 663个蛋白,16 341个肽段,其中含14 993个特有肽段。当蛋白丰度差异倍数达到1.3倍以上,且经统计检验其P值小于0.05时,视为差异蛋白,共鉴定差异蛋白225个,其中48个蛋白上调,177个蛋白下调。结论通过iTRAQ技术分析得到的DNT差异表达蛋白可靠,iTRAQ技术为筛选出有意义的DNT生物标记物提供了一个良好的平台。

• 出版日期2016
• 单位广州军区广州总医院