口腔鳞状细胞癌miR的生物信息学挖掘与分析

作者：樊丽娜; 胡雪刚; 邱在玲; 吕红兵; 周文土; 傅升^*

来源：福建医科大学学报, 2018, 52(03): 195-199.

• 癌,鳞状细胞
• 口腔
• 口腔肿瘤
• 微小RNA
• 计算生物学
• 生物学标记

目的筛选与口腔鳞状细胞癌(OSCC)相关的微小RNA(miR)生物标志物,并分析其靶基因的功能。方法从癌症基因组图谱数据库中下载人OSCC的miR高通量数据,使用R软件筛选差异miR,然后使用DAVID在线工具对选定的差异miR进行生物信息学分析。结果表达上调差异超过10倍的miR有11个,下调的miR有6个。差异miR靶基因预测共得到564个共同靶基因,GO功能注释显著富集于钙离子结合、金属离子、转换生长因子受体结合、磷脂酶的活动等功能。结论差异miR或许可作为OSCC重要的的分子标志物,为进一步探讨其在OSCC诊断或靶向治疗中的运用提供实验依据。

• 出版日期2018
• 单位福建医科大学; 福建医科大学附属口腔医院; 南京军区福州总医院