柯萨奇病毒B组4型河南分离株VP1区基因特征分析

作者：许玉玲; 王海霞; 卫海燕; 黄学勇

来源：中华实验和临床病毒学杂志, 2017, 31(06): 504-508.

• CoxB4病毒
• 手足口病
• VP1基因
• 系统进化树

目的了解河南省手足口病病原柯萨奇病毒B组4型(CoxB4)VP1区基因特征,并比较不同疾病来源CoxB4病毒分离株VP1区异同。方法对采集的手足口病患者临床标本134份进行RT-PCR扩增和病毒分离鉴定;通过设计CoxB4病毒VP1区特异性引物,对8株病毒进行PCR扩增,用生物学软件ATGC进行序列拼接,ClustalX1.83进行序列比对,BioEdit剪齐,MEGA4.0进行同源性分析和构建系统进化树。结果 CoxB4河南分离株VP1区长852 bp,与GenBank公布的其他分离株核苷酸相似性为80.3%97.0%,氨基酸相似性96.1%100%;与糖尿病患者分离株E2核苷酸差异最大为19.7%,与手足口病分离株差异最小为3.0%。系统进化树显示CoxB4河南分离株属于Genotype V型,手足口病分离株与脑膜炎分离株遗传距离较近,分布在一簇中,糖尿病患者分离株在另外一簇。结论河南地区手足口病感染CoxB4病毒存在Genotype V型传播和流行。

• 出版日期2017
• 单位河南省疾病预防控制中心