紫茎泽兰叶绿体基因RNA编辑位点的鉴定及分析

作者：吕萌荔; 王梦醒; 贾晓鸥; 邓平川; 聂小军; 宋卫宁

来源：西北农业学报, 2015, (02): 127-133.

• 紫茎泽兰
• 叶绿体
• RNA编辑
• 鉴定分析 Ageratina adenophora
• Chloroplast genome
• RNA editing
• Identification and analysis

RNA编辑是陆生植物叶绿体转录后基因表达调控的一种重要方式。本试验以紫茎泽兰为材料,利用生物信息学预测结合分子克隆及测序方法对其叶绿体的RNA编辑位点进行预测和分析。结果共预测到分布于19个基因的42个编辑位点,所有位点均为C到U的转换。编辑位点的发生位置分析发现,8个位于密码子第1位,34个位于密码子第2位,而密码子第3位未发现RNA编辑事件。同时,利用RT-PCR方法对其中4个基因的编辑位点进行验证,鉴定发现10个真实发生的编辑位点。进一步分析这10个位点发生编辑后对其编码蛋白质跨膜结构域和二级结构的影响,结果表明,ndhB-467的编辑会引起蛋白质跨膜结构的增加,ndhB-149的编辑会...

• 出版日期2015
• 单位西北农林科技大学