火龙果HuABAR的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位

作者：汤纬玮; 王庆竹; 李慧平; 文晓鹏^*

来源：华中农业大学学报, 2018, 37(05): 18-24.

DOI：10.13300/j.cnki.hnlkxb.2018.05.003

• 火龙果
• 非生物胁迫
• 脱落酸受体基因
• 生物信息学分析
• 亚细胞定位

在前期利用SSH筛选到抗旱相关基因HuABAR的Unigene序列的基础上,进行了HuABAR的全长cDNA克隆、生物信息学分析及亚细胞定位。结果表明:HuABAR基因cDNA全长为1 239bp,5′-UTR为264bp,3′-UTR为414bp,完整开放阅读框(ORF)共561bp,编码187个氨基酸;生物信息学分析显示,HuABAR基因编码蛋白具有典型的SRPBCC结构域,并与PYR1/PYLs(pyrabactin resistance 1/PYR1like)家族具有较高的相似性;HuABAR在干旱、高温(42℃)和低温(4℃)等逆境胁迫下显著上调表达,并在干旱胁迫5d、高温3d时表达量最高,低温处理5d内,表达量持续上升;通过PEG介导法瞬时转化拟南芥原生质体进行亚细胞定位分析,发现该基因定位于细胞质,与已报道的其他PYR1/PYLs家族基因一致。因此,HuABAR基因可能在火龙果干旱胁迫应答中发挥重要作用。

• 出版日期2018
• 单位生命科学学院; 贵州大学