广州市2001-2015年登革病毒2型E基因进化分析

作者：刘远; 蒋力云; 罗雷; 曹毅敏; 景钦隆; 杨智聪^*

来源：中华流行病学杂志, 2017, 38(01): 90-95.

• 登革病毒
• E基因
• 分子进化

目的了解2001-2015年广州市登革病毒2型(DENV2)的流行情况;通过对分离DENV2 E基因的进化树和分子钟分析, 掌握毒株的进化情况和趋势。方法将登革热确诊病例的血清用荧光PCR进行检测, DENV阳性血清用C6/36细胞进行病毒分离, 测定分离毒株的E基因序列, 利用Mega 4.0软件构建进化树, 采用BEASTv1.8.2绘制分子进化钟。结果 2001-2015年共分离到26株DENV2, 从基因型上分类属于全球型和亚洲1型, 并与东南亚地区分离到的毒株相似率较高;BEASTv1.8.2计算出广州市DENV2全球型在46年前和35年前进一步出现亚型的分化, 广州市DENV2的平均变异率为每年每位点7.1×10-4。结论广州市DENV2与东南亚地区的毒株有较高同源性和进化上的联系, 广州市DENV的输入压力较大, 存在重症登革热暴发的潜在风险。流行于广州市的全球型DENV2可能存在2个不同输入来源, 广州市DENV2的变异率与周边地区基本持平。

• 出版日期2017
• 单位广州市疾病预防控制中心