A20基因5′上游序列生物信息学分析

作者：陈潇; 吴丽娟

来源：国际检验医学杂志, 2010, (10): 1059-1061.

• 锌指
• 蛋白
• 基因
• 转录因子
• NF-κB
• 计算生物学 zinc fingres
• egg white
• Genes
• transcription factors
• NF-kappa B
• computational biology

目的 A20是一种胞浆瞬时表达蛋白,通过特定的信号通路负反馈调节体内炎症反应。为了解A20基因表达调控炎症的特点,对其5′上游序列进行生物信息学分析,获取基因调控的相关因素。方法从Genebank获取A20基因及其上游序列,利用promter2.0、Transfac 6.0、motif等生物信息学软件分析核转录因子的调控信息。结果结合多种软件分析,A20基因5′上游序列无典型的TATA盒和CAAT盒,且含有多个高度保守的核转录因子结合位点,包括3个与NF-kappa B结合的区域、4个与AP-1结合的区域、1个与HSF结合的位点、1个与Oct-1结合的位点等。结论 A20的表达调控受包括炎症重...

• 出版日期2010
• 单位中国人民解放军成都军区总医院