基于表达谱芯片挖掘抗猪瘟病毒相关基因及其在不同猪瘟抗体水平下的表达差异

作者：王晓铄; 俞英; 刘会杰; 肖丽; 翟立维; 敖红; 王楚端

来源：畜牧兽医学报, 2014, (01): 14-22.

• 猪
• 表达谱
• 差异表达基因
• 抗猪瘟病毒相关基因
• PolyI:C
• Aza-CdR swine
• microarray
• differentially expressed genes
• anti-CSF virus-related genes
• PolyI: C
• Aza-CdR

本研究旨在筛选抗猪瘟病毒相关基因,并分析不同猪瘟抗体水平下这些相关基因在大白和长白猪中的表达差异。首先,基于表达谱芯片技术,采用Agilent猪4×44K全基因组表达谱芯片,分析4组试验材料(病毒模拟物PolyI:C转染的猪PK15细胞、甲基化酶抑制剂Aza-CdR转染的PK15细胞、PolyI:C及Aza-CdR共同转染的PK15细胞、无处理的mock细胞),获得试验组间显著性差异表达基因。进而对差异表达基因进行聚类分析和Gene Ontology(GO)分析。结果表明,存在显著差异表达的抗粘液病基因(MX1)和双链RNA依赖的蛋白激酶R基因(PKR)主要参与抗病毒相关的生物学过程。分析2个...

• 出版日期2014
• 单位中国农业科学院北京畜牧兽医研究所; 中国农业大学