科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
目的:用分子对接软件对漆黄素与10个抗骨关节炎靶蛋白进行分子模拟对接研究,探讨其可能的抗骨关节炎作用机制,并根据配体与受体相互作用为漆黄素的结构修饰提供一定指导。方法:采用AutoDock 4.2分子对接软件,模拟漆黄素与10个抗骨关节炎靶蛋白的相互作用和结合模式,并将靶蛋白中的原始配体与对应的靶蛋白进行重对接实验。以估计抑制常数(Ki值)或结合自由能(△Gbind)等对接数据为参考,同时比较分子对接构象,分析漆黄素与各靶蛋白的结合模式。结果:漆黄素与TNF-α受体分子对接Ki值为7.10×10-2μmol·L-1,远小于相应原始配体分子对接Ki值(5.27×10-1μmol·L-1)。漆黄素与iNOS受体分子对接Ki值为2.54μmol·L-1,是其相应原始配体分子对接Ki值(7.16×10-2μmol·L-1)的35倍。漆黄素与TNF-α受体分子对接时,空间上与TNF-α受体的活性位点相互匹配,分子对接构象稳定,漆黄素结构中的3个酚羟基均与受体活性位点中的关键氨基酸形成了氢键相互作用力。漆黄素与iNOS受体分子对接时,占据了iNOS受体的细长活性腔,对圆形活性口袋作用较弱。结论:漆黄素对抗骨关节炎靶点的作用有一定的选择性,漆黄素与TNF-α受体结合作用强,表现出很强的虚拟抑制活性,可能是漆黄素发挥抗骨关节炎作用的主要作用靶点。漆黄素的3位羟基是提高其抗骨关节炎活性的主要结构修饰位点。
- 出版日期2021
- 单位赣南医学院
