基于高世代姊妹系发掘玉米穗长性状QTL及候选基因

作者:孙瑞东; 李艺萌; 黄然; 刘颖; 周筱航; 丁明阳; 刘新航; 吕香玲*; 李凤海
来源:植物遗传资源学报, 2023, 1-10.
DOI:10.13430/j.cnki.jpgr.20230717002

摘要

玉米穗长影响穗粒数,进而影响产量,是育种改良的重要目标性状之一。发掘与穗长性状相关QTL和基因对穗长性状进行遗传改良具有重要意义。本研究以一对穗长具有显著差异的高世代姊妹系为亲本,构建F2群体并自交得到F2:3,利用Maize6H-60K基因芯片分别对亲本及F2群体进行基因型分析,并通过ICIM、GCIM和dQTG -seq三种方法对F2和F2:3群体的穗长进行QTL定位。结果表明,三种方法共定位到7个与穗长相关QTL位点和43个QTNs,解释了2.04%-10.24%的表型变异。交叉分析不同方法得出的定位结果,在6号染色体上发现一个调控穗长的稳定QTL qEL6.01。根据定位区间内的基因注释的结果,并结合参考基因的表达谱数据,共筛选出5个在雌穗中表达的候选基因Zm00001d035514、Zm00001d035526、Zm00001d035537、Zm00001d035553和Zm00001d035535,本研究结果为玉米穗长基因的克隆及育种改良奠定了基础。

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