多倍体植物中单核苷酸多态性(SNPs)的开发

作者：贺道华; 邢宏宜; 赵俊兴; 赵艳宁; 齐程; 王艳婷

来源：浙江大学学报(农业与生命科学版), 2011, (05): 485-492.

• 多倍体
• 单核苷酸多态性
• 标记开发
• 部分同源性 polyploid
• single nucleotide polymorphism(SNP)
• marker discovery
• homoeology

单核苷酸多态性(SNP)是指在基因组水平上由单核苷酸的变异所引起的一种DNA序列多态性.在人、拟南芥、水稻等二倍体生物中,已经开发出大量的SNP标记并被用于群体结构分析、关联作图等研究,而在棉花、油菜、小麦等多倍体植物中,SNP的开发与应用却进展迟缓.为促进多倍体植物中SNP的开发,本文对多倍体植物中SNP标记开发所遇到的难题进行了阐述,并对多倍体中SNP标记开发方法进行了梳理,包括位点特异性引物的PCR片段直接测序,利用多倍体的近缘二倍体区分SNPs和部分同源序列间的差异(homoeologous sequence variants,HSVs),利用2代测序技术大规模发掘SNPs,基于公共数...

• 出版日期2011
• 单位西北农林科技大学