大豆GmWRI1a基因克隆及生物信息学分析

作者：王志坤; 常健敏; 李丹丹; 李文滨

来源：东北农业大学学报, 2013, (07): 11-16.

DOI：10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2013.07.003

• 大豆
• GmWRI1a基因
• 生物信息学
• 转录因子
• 含油量 soybean
• GmWRI1a gene
• bioinformatics analysis
• transcription factor
• oil content

利用Phytozome数据库、NCBI网站等软件对大豆(Glycine max)基因组中WRI1同源基因进行生物信息学分析,发现大豆WRI1转录因子有2个拷贝,分布在第8和15号染色体上。以大豆未成熟种子cDNA为模板,克隆15号染色体WRI1转录因子的cDNA全长序列,命名为GmWRI1a。应用生物学软件发现,GmWRI1a蛋白含有2个AP2/EREBP结构域(60-225)。进化树分析表明,GmWRI1a包含在第一个分支里,与AtWRI1距离较近,推断其与AtWRI1属于同源基因,具有相似的功能。对与GmWRI1a蛋白存在相互作用的蛋白进行预测分析,发现与其相互作用的蛋白多数参与糖降解或质...

• 出版日期2013
• 单位东北农业大学