大豆和拟南芥NFYB基因家族同义密码子使用偏好性的比较

作者：李真; 李永光; 薄蕾; 王鼎慧; 李文滨

来源：作物杂志, 2014, (03): 14-21.

DOI：10.16035/j.issn.1001-7283.2014.03.001

• 大豆
• 拟南芥
• NFYB基因
• 密码子偏好性 Soybean
• Arabidopsis
• NFYB gene family
• Codon bias

运用CodonW软件对大豆核因子NFYB(nuclear transcription factor Y B-subunit)基因家族CDS序列(coding sequence)的密码子组成、密码子使用性各参数和同义密码子相对使用度进行计算和统计分析,并与模式植物拟南芥NFYB基因进行比较。结果表明,NFYB基因家族CDS序列GC含量及同义密码子第3位的碱基含量直接影响着密码子使用偏好性程度的大小,并影响基因的表达水平。大豆GmNFYB基因与拟南芥AtNFYB基因对密码子的使用存在差异,AtNFYB基因家族偏好使用以A、U结尾的密码子,GmNFYB家族各基因偏好使用以G、C结尾的密码子。大豆不同...

• 出版日期2014
• 单位东北农业大学