杜洛克猪全基因组连锁不平衡分析

作者：刁淑琪; 罗元宇; 蔡迪; 陈桂华; 陈赞谋; 张豪; 李加琪; 张哲

来源：广东农业科学, 2016, 43(11): 116-121.

DOI：10.16768/j.issn.1004-874X.2016.11.018

• 猪
• 连锁不平衡
• 杜洛克
• SNP

利用猪Illumina Porcine SNP60K芯片对福建某核心种猪场杜洛克猪216个个体进行基因型检测,基于该高密度SNP芯片数据,运用Haploview软件计算全基因组连锁不平衡并构建杜洛克猪连锁不平衡图谱。结果表明,该杜洛克猪群体不同染色体上相邻标记间r2存在波动,波动范围为0.460.59,相邻标记间的平均连锁不平衡程度r2为0.52,SSC10的r2最低(平均为0.46),SSC6的r2最高(平均为0.59),连锁不平衡水平随着标记间距的增加而衰减、变异程度随之减小。该研究结果可为杜洛克猪遗传分析及全基因组选择研究提供参考。

• 出版日期2016
• 单位华南农业大学