拟南芥Argonaute1/2/4/5序列分歧以及与特定miRNA的协同表达(英文)

作者：赵文文; 韩颖颖; 刘宝林; 王志翠

来源：中国生物化学与分子生物学报, 2015, 31(01): 47-54.

DOI：10.13865/j.cnki.cjbmb.2015.01.08

• 系统发育分析
• argonaute
• miRNA的5’端碱基类型
• 亚适温度
• 脱水胁迫
• 协同表达

Argonaute(Ago)是RNA诱导的基因沉默复合体(RISC)中的一个重要组成部分,在RNA沉默通路中结合小RNA发挥着关键的作用.本文对12个物种的85个Ago/Ago-like基因序列进行了系统发育进化分析.结果表明,植物Ago可被分为3大分支,且基因在物种产生分歧之前就已经发生了重复.3个分支之间高同义和非同义突变频率揭示了Ago蛋白家族功能的高度保守性.采用实时荧光定量PCR对拟南芥Ago1/2/4/5在不同发育阶段和胁迫条件下的表达情况进行了分析.结果显示,Ago1在拟南芥幼苗和成熟组织中表达显著;与23℃(最适温度)相比,16℃(亚适温度)条件下,Ago1表达量显著下调,Ago5表达量则显著上调;在脱水胁迫下,Ago5表达量下调,Ago4表达量上调.另外,根据5’端碱基类型不同,188 954个幼苗miRNAs和2 047 843个成熟组织miRNAs被分类.结果显示,5’端为U的miRNAs在植物中的含量最多,这与Ago1表达量最高是协同的;16℃条件下,5’端为C的miRNAs和Ago5表达协同上调.这些结果都表明,Ago蛋白及其偏好的miRNAs是协同表达的.

• 出版日期2015
• 单位上海理工大学