牛和绵羊全基因组微卫星序列的搜索及其生物信息学分析

作者：戚文华; 蒋雪梅; 肖国生; 黄小云; 杜联明

来源：畜牧兽医学报, 2013, (11): 1724-1733.

• 牛
• 绵羊
• 基因组
• 微卫星序列
• 生物信息学 cow
• sheep
• genome
• microsatellite sequence
• bioinformatics

本研究利用MSDB v2.4搜索牛和绵羊全基因组中完整型微卫星序列,并对其进行生物信息学分析。牛基因组共统计了806 272个微卫星位点,其微卫星数量最多的是第1条染色体,其次是第2、3、4、5、6条染色体,数量较少的是第25和28条染色体。绵羊基因组共统计了682 891个位点,其微卫星数量最多的也是第1条染色体,其次是第2、3条染色体和X性染色体,数量较少的是第24、25、26条染色体。通过检验表明,牛和绵羊染色体长度与其所含微卫星数量具有高度正相关性(r>0.80,P=0.000)。牛和绵羊基因组中单碱基重复类型微卫星数量最多(45.33%vs 44.42%),其次依次是二碱基>三碱基>...

• 出版日期2013
• 单位四川大学; 重庆三峡学院