摘要
目的对青海省2016—2017年手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)人肠道病毒A组71型(human enterovirus group A type 71, EV-A71)的基因特征进行分析。方法对青海省2016—2017年采集的HFMD标本,用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)方法进行筛查,对EV-A71阳性标本进行病毒分离,对分离到的病毒提取核酸,用RT-PCR方法对VP1编码区进行扩增及核苷酸序列测定和分析,并与EV-A71各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。结果青海省2016—2017年共分离到114株EV-A71,均为C4基因亚型中的C4a进化分支。在亲缘性关系树中显示,又进一步分属2个不同的小分支。2016—2017年青海省流行的不同传播链上EV-A71与我国其他省流行的EV-A71基因亲缘关系较为接近。结论青海省2016—2017年流行的EV-A71以C4a为绝对优势基因亚型,未监测到其他基因型病毒。青海省EV-A71不是独立进化的,而是与我国其他地区流行的EV-A71共同进化。
- 出版日期2018
- 单位中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所; 青海省疾病预防控制中心