摘要

为明确侵染小构树(Broussonetia kazinoki)并引起叶片黄化卷曲症状的病毒种类及其基因组特征,本研究利用转录组高通量测序技术获得病毒基因组,利用PCR扩增和基因克隆技术对病毒基因组及其缺陷DNA进行鉴定。结果表明,通过转录组高通量测序和无参组装,获得引起小构树叶片黄化卷曲的双生病毒,命名为小构树卷叶病毒2(Kozo leaf curl virus2,KozoLCV-2)。进一步克隆测序获得的KozoLCV-2基因组全长为3 756~3 758 bp,其与构树卷叶病毒(Paper mulberry leaf curl virus2,PMLCV-2)具有相同的基因组结构和较高的序列一致性;病毒正义链编码4个ORF(V1、V2、V3和V4),互补链编码2个(C1和C1:C2),互补链存在选择性剪接。PCR扩增和克隆测序获得了10种KozoLCV-2的缺陷DNA(defective DNA,D-DNA)形式,其中9种完全或部分缺失复制酶区域,4种形式的D-DNAs与来自PMLCV-2-TL RepA第二外显子末端的序列发生了重组。

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