时序基因表达缺失值的加权双向回归估计算法

作者：李建更; 郭庆雷; 贺益恒

来源：数据采集与处理, 2013, (02): 136-140.

DOI：10.16337/j.1004-9037.2013.02.001

• 时序基因表达
• 空间相关性
• 时间相关性
• 加权双向回归
• 缺失值估计 sequential gene expression
• space correlation
• time correlation
• double weighted regression
• missing value estimation

由于受实验条件等客观因素制约,实验所得到的基因表达谱数据存在数据缺失的现象,不利于数据的后续使用。如何在不丢失数据信息、不影响数据整体使用的情况下,对实验数据进行估计、填充已成为目前生物信息学研究的热点。本文通过利用核加权函数提取与缺失值所在的行列具有最大相似性的行列信息,提出了基于双向核加权回归估计的算法。在回归过程中同时考虑基因表达的空间相关性和时间相关性信息,使回归算法使用的信息更加充分。通过与其他缺失值估计算法相比较,加权双向回归算法的估计结果较好。

• 出版日期2013
• 单位北京工业大学