桃FLA家族基因的生物信息学及表达分析

作者：卞坤; 邵佳蓉; 徐利伟; 沈子明; 陈伟; 杨震峰

来源：园艺学报, 2017, 44(04): 653-663.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0604

• 桃
• 果实
• 成束域
• 阿拉伯半乳糖蛋白
• 生物信息学
• 表达分析

从桃基因组数据库筛选出了12个假定的成束状阿拉伯半乳糖蛋白(FLA)基因序列。对其蛋白结构进行分析,结果显示PpFLA7不具有特定的阿拉伯糖或半乳糖糖基化位点,不属于典型的FLA家族。PpFLA6的氨基酸组成和保守域的分布与其他成员相比差别较大。聚类分析结果表明PpFLAs家族可以分为CladeⅠ、CladeⅡ和CladeⅢ3类。利用荧光定量PCR(qPCR)对不同组织和成熟阶段果实中的FLA进行表达分析,发现各个成员在不同时期的组织中差异化表达,其中PpFLA4在果实成熟阶段显著上调表达,暗示其可能在桃果实的成熟阶段扮演重要角色。

• 出版日期2017
• 单位浙江万里学院; 上海海洋大学