胡黄连2-C-甲基-D-赤藓糖-4-磷酸胞苷转移酶基因的生物信息学分析

作者：郑玉娟; 陈容; 周文化

来源：中草药, 2014, 45(15): 2218-2223.

• 2-C-甲基-D-赤藓糖-4-磷酸胞苷转移酶
• 胡黄连
• 丹参
• 生物信息学
• 蛋白质结构 2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylytransferase
• Picrorhiza kurrooa Pennel
• Salvia miltiorrhiza Alexander Bunge
• bio-informatics
• protein structure

目的研究胡黄连Picrorhiza kurrooa 2-C-甲基-D-赤藓糖-4-磷酸胞苷转移酶(MCT)基因特征并预测MCT结构与功能位点。方法以胡黄连MCT基因为研究对象,利用NCBI网站及生物信息学软件对其碱基分布、氨基酸组成、亲疏水性、保守区及二级结构和三级结构进行预测和分析;并对9个物种的MCT基因进行多重比对与进化分析。结果胡黄连MCT基因的mRNA序列长为1 216 bp(GenBank JQ991625.1),编码由399个氨基酸组成的蛋白质,该蛋白质相对分子质量为44 448.5,其中量最高的为Ser(10.0%);整个多肽中疏水性氨基酸占59.5%,平均疏水值为0.050;...

• 出版日期2014
• 单位中南林业科技大学