枣基因组的微卫星特征

作者：马秋月; 戴晓港; 陈赢男; 张得芳; 廖卓毅; ***

来源：林业科学, 2013, (12): 81-87.

• 枣
• 基因组
• 454测序
• 微卫星 Ziziphus jujuba
• genome
• 454 sequencing
• microsatellite

利用454高通量测序技术对枣基因组进行部分测序。经序列拼接,共获得总长约为8.4 Mb的基因组序列,从中找到15 036个微卫星重复序列。其中六碱基重复类型的重复数目最丰富,共6 033个,占重复序列总数的40.1%;其次是复合型碱基2 707个和单碱基2 575个,分别占重复序列总数的18.0%和17.1%。另外,二碱基重复1 118个,三碱基1 050个,四碱基1 218个,五碱基335个,分别占重复序列总数的7.5%,7.0%,8.1%,2.2%。通过分析发现六碱基重复类型所占比例最多,但微卫星重复单元的重复次数变化却是二碱基微卫星显著高于其他各重复类型。在单碱基重复和二碱基重复这2种类...

• 出版日期2013
• 单位南京林业大学