Hepatitis B virus sequencing and liver fibrosis evaluation in HIV/HBV co-infected Nigerians

作者:Grant Jennifer*; Agbaji Oche; Kramvis Anna; Yousif Mukhlid; Auwal Mu'azu; Penugonda Sudhir; Ugoagwu Placid; Murphy Robert; Hawkins Claudia
来源:Tropical Medicine and International Health, 2017, 22(6): 744-754.
DOI:10.1111/tmi.12873

摘要

ObjectivesMolecular characteristics of hepatitis B virus (HBV), such as genotype and genomic mutations, may contribute to liver-related morbidity and mortality. The association of these characteristics with liver fibrosis severity in sub-Saharan Africa is uncertain. We aimed to characterise molecular HBV features in human immunodeficiency virus (HIV)/HBV co-infected Nigerians and evaluate associations between these characteristics and liver fibrosis severity before and after antiretroviral therapy (ART) initiation. MethodsHIV/HBV co-infected Nigerians underwent liver fibrosis estimation by transient elastography (TE) prior to and 36months after ART initiation. Basal core promoter/precore (BCP/PC) and preS1/preS2/S regions of HBV were sequenced from baseline plasma samples. We evaluated associations between HBV mutations and liver fibrosis severity by univariate and multivariable regression. ResultsAt baseline, 94 patients underwent TE with median liver stiffness of 6.4 (IQR 4.7-8.7) kPa. Patients were predominantly infected with HBV genotype E (45/46) and HBe-antigen negative (75/94, 79.8%). We identified BCP A1762T/G1764A in 15/35 (43%), PC G1896A in 20/35 (57%), a' determinant mutations in 12/45 (26.7%) and preS2 deletions in 6/16 (37.5%). PreS2 mutations were associated with advanced fibrosis in multivariable analysis. At follow-up, median liver stiffness was 5.2 (IQR 4.1-6.6) kPa. No HBV molecular characteristics were associated with lack of fibrosis regression, although HIV virologic control, body mass index (BMI) and baseline CD4+ T-cell count were associated with a decline in fibrosis stage. ConclusionFrequent BCP/PC and preS1/preS2/S mutations were found in ART-naive HIV/HBV co-infected Nigerians. Median liver stiffness declined after initiation of ART, regardless of pre-ART HBV mutational pattern or virologic characteristics. ObjectifsLes caracteristiques moleculaires du virus de l'hepatite B (VHB), telles que le genotype et les mutations genomiques, peuvent contribuer a la morbidite et a la mortalite liees au foie. L'association de ces caracteristiques avec la severite de la fibrose hepatique en Afrique subsaharienne est incertaine. Nous avons cherche a caracteriser les caracteristiques moleculaires du VHB chez les nigerians coinfectes par le VIH/HBV et evaluer les associations entre ces caracteristiques et la severite de la fibrose hepatique avant et apres l'initiation du traitement antiretroviral (ART). MethodesDes nigerians coinfectes par le VIH/VHB ont subi une estimation de la fibrose hepatique par elastographie transitoire (ET) avant et 36 mois apres l'initiation de l'ART. Le promoteur/precore du noyau basal (BCP/PC) et les regions preS1/preS2/S du VHB ont ete sequences a partir d'echantillons de plasma preleves au depart. Nous avons evalue les associations entre les mutations du VHB et la severite de la fibrose hepatique par regression univariee et multivariee. ResultatsAu depart, 94 patients ont subi une ET avec une rigidite mediane du foie de 6,4 kPa (IQR: 4,7-8,7). Les patients etaient principalement infectes par le genotype E du VHB (45/46) et negatifs pour l'antigene HBe (75/94, 79,8%). Nous avons identifie BCP A1762T/G1764A chez 15/35 (43%), PC G1896A chez 20/35 (57%), des mutations determinantes a' chez 12/45 (26,7%) et des deletions preS2 chez 6/16 (37,5%) patients. Les mutations PreS2 ont ete associees a une fibrose avancee dans l'analyse multivariee. Lors du suivi, la raideur mediane du foie etait de 5,2 kPa (IQR 4,1-6,6). Aucune caracteristique moleculaire du VHB n'a ete associee a un manque de regression de la fibrose, quoique le controle virologique du VIH, l'indice de masse corporelle (IMC) et le taux de lymphocytes T CD4+ de base aient ete associes a un declin du stade de la fibrose. ConclusionDes mutations BCP/PC et preS1/preS2/S frequentes ont ete trouvees chez les nigerians coinfectes par le VIH/VHB non traites par l'ART. La rigidite mediane du foie diminuait apres l'initiation de l'ART quelque soit le profil mutationnel VBH pre-ART ou les caracteristiques virologiques. ObjetivosCaracteristicas moleculares del virus de la hepatitis B (VHB), tales como mutaciones genotipicas y genomicas, podria contribuir a la morbilidad y mortalidad hepaticas. La asociacion de estas caracteristicas con la severidad de fibrosis hepatica en africa subsahariana es incierta. Nuestro objetivo era determinar las caracteristicas moleculares del VHB en nigerianos coinfectados con VIH/VHB y evaluar las asociaciones entre estas caracteristicas y la severidad de la fibrosis hepatica antes y despues del inicio de la terapia antirretroviral (TAR). MetodosA los nigerianos coinfectados con VIH/VHB se les realizo un calculo de la fibrosis hepatica mediante elastografia transitoria (ET) antes de y 36 meses despues de la iniciacion de TAR. Se secuenciaron las regiones BCP/PC y preS1/preS2/S del VHB a partir de muestras de plasma recogidas al inicio del estudio. Evaluamos las asociaciones entre las mutaciones de VHB y la severidad de la fibrosis hepatica mediante regresion univariada y multivariada. ResultadosAl comienzo del estudio, se les realizo ET a 94 pacientes, obteniendo una rigidez hepatica media de 6.4 (IQR 4.7-8.7) kPa. Los pacientes estaban predominantemente infectados con el genotipo E del VHB (45/46) y eran negativos para el antigeno HBe (75/94, 79.8%). Identificamos el BCP A1762T/G1764A en 15/35 (43%), PC G1896A en 20/35 (57%), una mutacion determinante en 12/45 (26.7%), y deleciones preS2 en 6/16 (37.5%). Las mutaciones preS2 estaban asociadas con una fibrosis avanzada segun un analisis multivariable. Durante el seguimiento, la rigidez mediana del higado era de 5.2 (IQR 4.1-6.6) kPa. No habia caracteristicas moleculares del VHB asociadas con la falta de regresion de la fibrosis, aunque el control virologico del VIH, el indice de masa corporal (IMC) y los conteos de celulas T CD4+ al comienzo del estudio estaban asociadas con una disminucion en el estadio de fibrosis. ConclusionSe encontraron frecuentemente las mutaciones BCP/PC y preS1/preS2/S en nigerianos coinfectados con VIH/VHB que no habian recibido TAR. La rigidez hepatica media disminuyo despues del inicio de TAR, independientemente del patron del VHB o de las caracteristicas virologicas antes del TAR.