口蹄疫病毒A/GDMM/CHA/2013株结构蛋白VP1 H-2d限制性CTL表位预测

作者：尚延丽; 冯霞; 靳野; 张晓霞; 张柳; 马军武

来源：安徽农业科学, 2015, 43(16): 146-149.

DOI：10.13989/j.cnki.0517-6611.2015.16.053

• 口蹄疫病毒
• 结构蛋白VP1
• H-2d限制性T细胞表位
• 生物信息学

[目的]预测A型口蹄疫病毒结构蛋白VP1的H-2d限制性T细胞表位。[方法]使用多种在线表位预测软件,包括Syfpeithi、IEDB、Net MHC-3.2、IMTECH和BIMAS预测A型口蹄疫病毒VP1上可能有的H-2d限制性T细胞表位,然后用Prot Param软件分析预测出的候选表位。[结果]综合比较5个表位预测软件的预测结果,遴选出10个候选表位;再结合Prot Param软件分析结果,最后共预测出5个表位:其中H-2Kd限制性表位有第2735、118126位,H-2Ld限制性表位有第4351位,H-2Dd限制性表位有第4553、146154位。[结论]预测出5条口蹄疫病毒结构蛋白VP1 H-2d限制性CTL表位,为进一步鉴定口蹄疫病毒CTL表位提供数据和基础。

• 出版日期2015
• 单位中国农业科学院兰州兽医研究所; 家畜疫病病原生物学国家重点实验室