侵染梨的苹果茎痘病毒基因组序列及小RNA分析

作者：刘华珍; 杨作坤; 周友斌; 王国平; 洪霓

来源：植物病理学报, 2017, 47(05): 584-590.

DOI：10.13926/j.cnki.apps.000115

• 苹果茎痘病毒
• 梨
• 基因组
• 小RNA

苹果茎痘病毒(Apple stem pitting virus,ASPV)是危害梨(Pyrus spp.)和苹果(Malus spp.)的重要病毒。本研究采用小RNA深度测序技术获得了ASPV基因组的部分序列,在此基础上设计引物对该病毒基因组进行RT-PCR扩增,通过序列拼接得到1个来源于玉露香(Yuluxiang)梨的ASPV分离物(YLX)长度为9 291个核苷酸(nt)(不包括基因组5’末端约30个核苷酸)的基因组序列,该序列与已报道的13个ASPV分离物的基因组核苷酸序列相似性为71.6%80.7%,与多个来自苹果的ASPV分离物系统进化关系较近。首次分析了来源于ASPV基因组的干扰性小RNA(siRNA),发现来源于ASPV基因组链和互补链的siRNA长度均以21 nt和22 nt为主,siRNA的5’端具有一定的碱基偏好性。本研究结果为深入了解ASPV的分子特性提供了重要信息。

• 出版日期2017
• 单位农业微生物学国家重点实验室; 华中农业大学