橡胶树EST-SSRs发掘研究

作者：华玉伟; 卢轶; 龙青姨; 曾霞; 胡彦师; 黄华孙

来源：热带作物学报, 2008, 29(05): 583-588.

DOI：10.3969/j.issn.1000-2561.2008.05.010

• 橡胶树
• 分子标记
• EST-SSRs

随着橡胶树大量ESTs序列的产生,为EST-SSRs发掘提供了丰富的公共序列资源。本研究首先将11809条橡胶树ESTs组装成3932条非冗余序列,其中323条ESTs检索到SSRs358个,SSRs出现的频率为9.1%。SSR重复单元共93种,其中二核苷酸重复(57.5%)、三核苷酸重复(26.0%)和六核苷酸重复(12.8%)占所有重复单元的96.3%。对323条SSR-ESTs进行特异扩增引物设计,共获得158对引物,对48份包括31份魏可汉种质、12份1981'野生种质、2份色宝橡胶、2份光亮橡胶和1份少花橡胶扩增,其中60对引物扩增出1条预期长度DNA片段,占所有设计引物的38%,并筛选到40对具有多态性的引物。EST-SSRs标记的发掘为巴西橡胶树分子辅助育种、种质资源功能遗传多样性分析等研究提供了良好的标记。

• 出版日期2008-10-22
• 单位农业部; 中国热带农业科学院橡胶研究所