滇龙胆异戊烯基焦磷酸异构酶基因的克隆与表达分析

作者：张玲; 李彩霞; 张海晨; 马娜; 杨娇; 张晓东

来源：广东农业科学, 2015, 42(17): 139-146.

DOI：10.3969/j.issn.1004-874X.2015.17.025

• 滇龙胆
• 异戊烯基焦磷酸异构酶
• 基因克隆
• 生物信息学分析
• 表达分析

根据药用植物滇龙胆转录组异戊烯基焦磷酸异构酶基因(GrIDI)序列,应用RT-PCR技术从滇龙胆幼叶克隆该基因开放阅读框(ORF),获得GrIDI1和GrIDI2两条序列,其GenBank登录号分别为KM879183和KM879184.生物信息学分析表明GrIDI1基因ORF长708 bp,编码235氨基酸;GrIDI1蛋白相对分子质量为27.10 ku,理论pI为5.01.该蛋白属于Ⅰ型异戊烯基焦磷酸异构酶家族成员,可能定位于细胞质.该蛋白无信号肽,为亲水稳定蛋白,主要由α-螺旋(45.53％)和无规则卷曲(39.57％)构成.该蛋白具有其他IDI蛋白的活性位点、金属结合位点和保守结构域(NUDIX羟化酶结构域).GrIDI1蛋白与黄龙胆GlIDI蛋白亲缘关系最近.原核表达结果表明,GrIDI1基因在大肠杆菌中表达的重组蛋白相对分子质量约为53.11ku,与预期大小一致.组织特异性表达分析结果表明GrIDI1基因主要在叶中表达.

• 出版日期2015
• 单位玉溪师范学院