牛病毒性腹泻病毒结构蛋白基因的克隆及其B细胞抗原表位的预测

作者：何延华; 黄新; 薄新文; 钟发刚; 韩猛立; 陈南颖; 王新华

来源：新疆农业科学, 2012, (02): 310-317.

• 牛病毒性腹泻病毒
• 结构蛋白
• B细胞表位
• 二级结构
• 反向疫苗学 Bovine Viral Diarrhea Virus(BVDV)
• structural protein
• B cell epitope
• secondary structure
• reverse vaccinology

【目的】以免疫信息学和反向疫苗学为理论根据,应用生物信息学相关软件和方法,对BVDV结构蛋白(Structural Protein,SP)的二级结构的不同方面及其B细胞表位进行了预测,综合评价了BVDV结构蛋白的抗原特异性细胞表位,并计算出一些潜在的抗原位点。【方法】利用RT-PCR扩增法获得牛病毒性腹泻病毒结构蛋白序列,通过克隆、测序分析结构蛋白基因的基因组序列和蛋白序列,采用DNAStar Protean软件对结构蛋白的二级结构、可塑性、亲水性、表面可及性及抗原指数等参数进行综合分析,并预测其B细胞的抗原表位分布。【结果】P14、gp48和gp53蛋白含有的细胞优势抗原表位较多,有的甚至有...

• 出版日期2012
• 单位新疆农垦科学院